RT-PCR Kit(逆转录试剂盒)
产品说明
RT-PCR Kit(逆转录试剂盒)是专为两步法RT-PCR第一步实验配制的、具有高灵敏度的RT-PCR反应系统。该系统合理配备了与cDNA第一链合成反应相关的各种组分,优化的体系保证了M-MLV具有高效的逆转录酶活性,所得cDNA对后续的PCR或定量PCR实验兼容性好,可用于检测稀有基因的表达、从极少数细胞中定量检测特定mRNA的表达水平、克隆特定基因的cDNA片段等。
M-MLV逆转录酶是由一个71 kD的单亚基组成的重组型DNA逆转录聚合酶。可以催化以RNA或DNA:RNA杂交链为模板的互补DNA 的聚合反应。本酶经修饰RNase H活性比普通的逆转录酶要弱很多,因此在合成第一链cDNA的过程中,可保证RNA的降解程度较低,从而使得率提高。
产品组分
货号 | R1011(20次) | R1012(100次) |
M-MLV(200U/µl) | 20 μl | 100 μl |
RNasin(40U/µl) | 12 μl | 60 μl |
Oligo d(T)15 Primer(50 μM) | 20 μl | 100 μl |
Random primer(50 μM) | 20 μl | 100 μl |
5xfirst-strand buffer | 80 μl | 400 μl |
RNase-free ddH2O | 1 ml | 1 ml×5 |
dNTPs(10mM each) | 50 μl | 250 μl |
R1011可进行20次逆转录反应,R1012可进行100次逆转录反应(20 μl 标准PCR反应体系,每次使用 M-MLV 1μl)。
M-MLV 储存液
20 mM Tris-HCl (pH 7.5)
200 mM NaCl
0.1 mM EDTA
1 mM DTT
0.01% NP-40
50% glycerol
5xfirst-strand buffer 成分
250 mM Tris-HCl (pH 8.3 at 25℃)
375 mM KCl
15 mM MgCl2
50 mM DTT
质量检测
逆转录酶活性检测
使用[32P]dCTP作为标记,200 U的 M-MLV以1μg、1.2 kb的RNA为模板进逆转录反应,最低可得到120ng的cDNA,所得cDNA长度 > 全长的90%。
核酸外切酶活性检测
混合50ng的标记DNA 或RNA与200U M-MLV在1×反应缓冲液体系中,37℃温浴1 h,检测DNA和RNA降解都不到总量的1%。
适用范围
第一链cDNA 合成
cDNA文库构建
RT-PCR
引物延伸
3'和5' RACE
注意事项
l 成功的cDNA合成来自高质量的RNA。高质量的RNA至少应保证全长的完整性并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或 SDS。用于cDNA合成反应的溶液试剂尽可能用DEPC进行处理,并在高压灭菌后使用。有些试剂不能用高压灭菌处理时,首先用经过灭菌的器具、水等配制溶液后,再将溶液进行过滤除菌处理。
l 为了增加贮存RNA样品的稳定性,可以将RNA溶解在去离子的甲酰胺中,存于-70℃。用于保存 RNA 的甲酰胺一定不能含有降解RNA的杂物。来源于胰脏的RNA至少可以在甲酰胺中保存一年。当准备使用RNA时,可以使用下列方法沉淀RNA:加入NaCl至0.2 M同时加入4倍体积的乙醇,室温放置3-5 min,10,000 rpm离心5 min。
l 在逆转录反应中经常加入RNase抑制剂(RNasin)以增加cDNA合成的长度和产量。在第一链合成反应中,RNase抑制剂在缓冲液和还原剂(如 DTT)存在的条件下加入,因为cDNA合成前的过程会使抑制剂变性,从而释放出RNase。但是RNase抑制剂仅防止RNase A,B,C 对RNA的降解,并不能防止皮肤上的RNase,因此尽管使用了RNase抑制剂,也要小心不要从手指上引入RNase。
l 较高的保温温度有助于RNA二级结构的打开,增加反应的产量。
l 使用简单的RNA纯化方法即可获得满足RT-PCR反应的RNA,但为了保证实验的成功率,建议使用GTC法(异硫氰酸胍法)制备的高纯度RNA。
l 为防止RNA降解,应尽量避免反复冻融,最好保存于-70℃。
l 最佳的PCR反应条件,因PCR扩增仪的不同而不同,所以在使用您的样品之前最好先试做一下control反应,以确定最佳的PCR反应条件。
l cDNA产物应置于-20℃保存。
l 当以cDNA为模板进行PCR之前,使用RNase H处理cDNA,可以提高PCR反应的灵敏度。
操作步骤
1 在冰浴的无菌离心管中配制下列混合物
1-5μg RNA
1μl Oligo(dT)15 或Random primer,
补RNase-free ddH2O至13.4μl;
2进行变性退火反应
70℃温浴5 min,
简短离心后冰浴5 min;
3在上述离心管中配制反转录反应液
4 μl 5×first-strand buffer
1 μl dNTPs(10 mM each)
0.6μl RNasin ,
1 μl M-MLV;
4按下列条件进行反转录反应
Oligo (dT)15 :42℃温浴60 min;
Random primer: 37℃温浴60 min。
5终止反应
70℃温浴5 min终止反应,置冰上进行后续实验或-20℃保存。
6用RNase-free ddH2O将反应体系稀释到50μl,取2-5μl进行PCR扩增反应。